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MassArray SNP基因分型技术服务

询价
2021-06-10 10:36

江苏楚天生物科技有限公司

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江苏楚天生物科技有限公司
经理
0519-89886883
1@ctbioscience.com
产品属性
服务名称 Agena MassArray SNP基因分型技术服务
提供商 江苏楚天生物科技有限公司
产品说明

服务简介


MassARRAYSNP基因分型技术,是由美国Agena Bioscience, Inc.(原Sequenom Bioscience Division)公司开发的基于飞行质谱的分型技术,江苏楚天生物(CT Bioscience)为该公司中国区授权服务商(Agena Certified Service Provider Certificate)。
 

 
                                                   


该技术通过PCR扩增跨越SNP位点的DNA序列,然后应用单一延伸引物(extension primer)扩增PCR产物,确保延伸引物只延长一个碱基。延伸产物用飞行质谱(TOF, time of flight)进行分析,根据一个碱基的分子量差别对SNP进行分型,也可做SNP位点等位基因频率计算。MassARRAY SNP基因型分析可以进行多重SNP分型,即一个反应可同时分型多个SNP位点。该技术分析准确,在分析数十上百个SNP时具有价格优势。




技术原理


MassARRAY飞行质谱检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 技术。将制备好的样品与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离,在真空小管中飞行到达检测器,飞行时间与离子质量成正比。MALDI产生的离子用飞行时间(Time-of-Flight,TOF)检测器来检测,离子质量越小,飞行时间越短。理论上讲,只要飞行管长度足够,TOF 检测器可检测分子的质量数是没有上限的。



图1 飞行时间质谱检测物质分子量的原理

 

应用领域


MassARRAY SNP基因型分析在生物科学、医学、农业研究和应用等多个领域具有非常好的应用前景,为全世界的科学家们提供优质的解决方案,获得了瞩目的进展。以下是一些代表文献:

 

技术特点

 高性价比:在所有的SNP分型方法中,价格最低。
 高准确性:采用尖端的飞行质谱的分型技术,能准确检测出单个碱基的差异,分析精准。
 高灵敏度:检测窗口内,能被检测任何pmol级的物质。
 高通量:一张芯片可对384个样本进行多重检测,每个体系最多实现36重反应。
 灵活性:几秒钟就能检测一个反应孔,每天可完成几个乃至上万个反应。
 无污染:在实验过程中,反应体系始终在同一个试管内进行,无多次转移,减少污染的概率。
 高效性:最快2周即可提供完整的实验报告。
 广泛性:超过2000篇SCI文章,包括Nature, Science等顶尖杂志。


江苏楚天生物为您提供以下技术服务,也可根据客户需求定制技术服务:
 
产品名称 用途 检测位点数
iPLEX® ADME PGx Pro Panel 药物个性化治疗 36个药物代谢关键基因的184SNP及部分CNV
LungCarta™ Panel 肺癌检测 检测26个肺癌相关致癌基因和抑癌基因的214个突变位点
OncoCarta™ Panel 系列V1.0 肿瘤检测 检测19个致癌基因,238个突变位点
OncoFOCUS™ Panel 结直肠癌 BRAF 19个、EGFR 127个、KRAS 38个、NRAS20个突变
MelaCarta Panel 黑色素瘤检测 检测黑色素瘤相关的20个基因的70多种突变
Hemo ID™ Blood Group 系列 稀有血型鉴定 上百种稀有血型系统多态性检测
ALK/RET/ROS1 Panel ALK/RET/ROS1 检测肿瘤中的ALK/RET/ROS1的已知或未知易位
 

设备仪器

分型方法 设备仪器
MassARRAY MassARRAY Genetic Analysis System



图2 MassARRAY Genetic Analysis System平台示意图

 

样品类型

所有类型样品必须用冰袋寄至公司。冰块应足量,以确保样品寄至公司时,冰块未完全融化。

  • a)组织样品(需提供≥100mg组织。)
  • b)体外培养细胞(需提供≥106个细胞。)
  • c)基因组DNA (需提供≥5μg 基因组DNA)
  • d)全血(需提供≥2mL全血)
 

价格

SNP分型(或基因突变检测)的费用根据需要分型的SNP位点,数目以及样品数量的不同而制定。

 

提交数据

分型结果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飞行质谱分析图:



图3 MassARRAYSNP基因分型飞行质谱部分分析图


如需要,可提供所使用方法的原始数据。

 

实验周期

10-30个工作日



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