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生物芯片数据分析服务

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2021-06-08 17:22

北京与翔科飞生物信息科技有限公司

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北京与翔科飞生物信息科技有限公司
张先生
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产品属性
服务名称 生物芯片数据分析服务
产品说明
            与翔科飞提供专业的生物信息学服务,包括生物信息学软件定制、设计及算法整合、具体疑难生物学数据分析、高通量生物学数据分析,以及基于生物信息学分析探路的实验路线设计等。
1.基因表达谱数据分析
 
2.MicroRNA芯片分析
 
5.arrayCGH分析

生数据标准化 (Raw data normalization)    对原始数据进行处理,通过特定的统计分析,达到消除背景噪音,过滤脏数据,去除同一实验不同block之间、不同芯片之间的实验误差,使不同芯片的数据具有可比性。

 

差异表达分析 (DEG analysis)    差异表达分析是芯片数据的基本分析手段之一,不同方法适用于不同的数据,常用的方法有limma,SAM,T-test ,Fisher’s exact test等。

miRNA靶标基因的预测(miRNA target prediction)   选取在十多种预测方法中至少有5种预测算法预测一致的靶基因


miRNA-mRNA调控网络(miRNA regulation network)   基于MicroRNA的负调控属性,选取显著负相关的miRNA和gene进行网络分析

 

 
3.SNP芯片分析
4.DNA甲基化芯片分析
芯片质量控制 (Quality control)     通过对数据的各项指标的分析作图,可以评估芯片实验质量,了解数据的分布规律,并为下一步分析方法提供参考。
 
生数据标准化 (Raw data normalization)    对原始数据进行处理,通过特定的统计分析,达到消除背景噪音,过滤脏数据,去除同一实验不同block之间、不同芯片之间的实验误差,使不同芯片的数据具有可比性。下图为数据标准化前(左图)后(右图)数据的盒图,表示各芯片数据的数值分布。
 

差异甲基化区域鉴定(Differential methylation region identification)   差异甲基化区域鉴定是为了发掘样本中显著高甲基化或者低甲基化的位点。

甲基化差异区域基因富集分析 (Gene enrichment analysis in differential methylation region)
 

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