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多肽的蛋白质结构分析

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2022-08-05 20:00

北京百泰派克生物科技有限公司

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关于百泰派克
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北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关分析服务,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,为客户提供优质的蛋白组学多肽组学代谢组学多组学生物制药分析服务。提供包括蛋白鉴定定量蛋白组iTRAQ/TMTlabel freeDIA/SWATH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键糖基化磷酸化乙酰化泛素化等)、多肽组学整合组学,靶向和非靶向代谢物检测。

北京百泰派克生物科技有限公司(Beijing Bio-Tech Pack Technology Company Ltd. 简称BTP)从事蛋白质和小分子代谢物的理化性质分析及结构解析等相关分析服务,业务范围主要围绕蛋白和小分子代谢物检测两大板块,为客户提供优质的蛋白组学蛋白组学,多肽组学多肽组学,代谢组学代谢组学,多组学多组学及生物制药分析服务生物制药分析服务。提供包括蛋白鉴定蛋白鉴定、定量蛋白组定量蛋白组(iTRAQ/TMTiTRAQ/TMT、label freelabel free、DIADIA/SWATHSWATH)、PRM靶蛋白定量、蛋白和抗体测序、蛋白修饰(二硫键二硫键、糖基化糖基化、磷酸化磷酸化、乙酰化乙酰化、泛素化等泛素化等)、多肽组学多肽组学、整合组学整合组学,靶向和非靶向代谢物检测。

 

 
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服务项目
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蛋白分析 蛋白质组学 代谢组学 多组学整合分析 生物制药分析
 
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蛋白鉴定蛋白鉴定 分子量测定分子量测定 肽质量指纹图谱分析肽质量指纹图谱分析 膜蛋白鉴定服务膜蛋白鉴定服务 蛋白质质谱鉴定蛋白质质谱鉴定 Pull-down靶蛋白质谱鉴定Pull-down靶蛋白质谱鉴定 Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定Shotgun鸟枪法蛋白质鉴定 序列分析序列分析 蛋白测序蛋白测序 蛋白质N/C端测序蛋白质N/C端测序 蛋白全序列测定蛋白全序列测定 多肽测序多肽测序 抗体测序抗体测序 单克隆抗体从头测序单克隆抗体从头测序 蛋白从头测序和突变分析蛋白从头测序和突变分析 多肽从头测序多肽从头测序 基于Edman降解的蛋白质N端测序基于Edman降解的蛋白质N端测序 蛋白质相互作用分析蛋白质相互作用分析 蛋白质相互作用质谱分析蛋白质相互作用质谱分析 CO-IP免疫共沉淀法CO-IP免疫共沉淀法 GST pull-downGST pull-down SILAC与免疫共沉淀质谱联用SILAC与免疫共沉淀质谱联用 交联法蛋白相互作用分析交联法蛋白相互作用分析 Far-Western Blot分析Far-Western Blot分析 标记转移法蛋白相互作用分析标记转移法蛋白相互作用分析 蛋白质结构鉴定蛋白质结构鉴定 蛋白质圆二色谱分析蛋白质圆二色谱分析 蛋白质一级结构的测定蛋白质一级结构的测定 定量蛋白质组学定量蛋白质组学 Label FreeLabel Free iTRAQ, TMT, SILACiTRAQ, TMT, SILAC DIA定量蛋白质组学DIA定量蛋白质组学 半定量蛋白质组学半定量蛋白质组学 2D-DIGE定量蛋白质组学2D-DIGE定量蛋白质组学 SWATH定量蛋白组学SWATH定量蛋白组学 靶向蛋白质组学靶向蛋白质组学 MRM/PRM定量蛋白组学MRM/PRM定量蛋白组学 绝对定量分析(AQUA)绝对定量分析(AQUA) 多肽组学多肽组学 肽纯度分析肽纯度分析 多肽质谱鉴定多肽质谱鉴定 多肽生物标志物鉴定多肽生物标志物鉴定 翻译后修饰蛋白组学翻译后修饰蛋白组学 磷酸化定量蛋白组学研究磷酸化定量蛋白组学研究 糖基化定量蛋白组学研究糖基化定量蛋白组学研究 乙酰化定量蛋白组研究乙酰化定量蛋白组研究 泛素化定量蛋白组学研究泛素化定量蛋白组学研究 蛋白二硫键鉴定和定量分析蛋白二硫键鉴定和定量分析 组蛋白翻译后修饰分析组蛋白翻译后修饰分析 S-亚硝基化分析S-亚硝基化分析 甲基化定量蛋白组学研究甲基化定量蛋白组学研究 酰化定量蛋白质组研究酰化定量蛋白质组研究 蛋白质SUMO化鉴定蛋白质SUMO化鉴定 基于Top down自上而下法的PTMs表征基于Top down自上而下法的PTMs表征 4D蛋白质组学4D蛋白质组学 糖蛋白组学糖蛋白组学 非靶向代谢组学非靶向代谢组学 靶向代谢组学靶向代谢组学 氨基酸及其衍生物氨基酸及其衍生物 糖类及糖代谢糖类及糖代谢 肉碱和酰基肉碱类肉碱和酰基肉碱类 植物激素植物激素 胆汁酸胆汁酸 维生素与辅酶维生素与辅酶 动物激素动物激素 脂肪酸及脂肪酸代谢脂肪酸及脂肪酸代谢 ATP代谢相关物质分析ATP代谢相关物质分析 NAD代谢相关物质分析NAD代谢相关物质分析 白藜芦醇白藜芦醇 木酚素木酚素 多酚多酚 黄酮黄酮 生物胺生物胺 有机酸有机酸 类胡萝卜素类胡萝卜素 氧化型胆固醇氧化型胆固醇 核苷酸及相关物质分析核苷酸及相关物质分析 短链脂肪酸短链脂肪酸 脂质代谢组学脂质代谢组学 脂质组学MALDI成像服务脂质组学MALDI成像服务 离子组学离子组学 未知代谢物鉴定未知代谢物鉴定 外源性代谢物分析外源性代谢物分析 代谢通量分析代谢通量分析 脂质组学+蛋白质组学脂质组学+蛋白质组学 转录组学+代谢组学转录组学+代谢组学 转录组学+蛋白质组学转录组学+蛋白质组学 转录组学+脂质组学转录组学+脂质组学 蛋白质组学+代谢组学蛋白质组学+代谢组学 翻译后修饰蛋白质组+代谢组翻译后修饰蛋白质组+代谢组  
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非变性质谱分析(Native MS)非变性质谱分析(Native MS) SDS-PAGE蛋白质纯度分析SDS-PAGE蛋白质纯度分析 蛋白质纯度分析(分子筛/反相色谱)蛋白质纯度分析(分子筛/反相色谱) 宿主蛋白残留(HCP)分析宿主蛋白残留(HCP)分析 抗体偶联药物(ADCs)分析抗体偶联药物(ADCs)分析 生物药糖谱检测生物药糖谱检测 生物药糖基化位点检测生物药糖基化位点检测 生物药二硫键/游离半胱氨酸检测生物药二硫键/游离半胱氨酸检测 抗体C端K缺失比例分析抗体C端K缺失比例分析 高分辨质谱分子量鉴定高分辨质谱分子量鉴定 MALDI TOF分子量分析MALDI TOF分子量分析 生物制药N端测序生物制药N端测序 生物制药N/C端测序生物制药N/C端测序 肽段覆盖率/肽谱图分析肽段覆盖率/肽谱图分析 蛋白质肽谱图测定蛋白质肽谱图测定 生物药氨基酸组成分析生物药氨基酸组成分析 氢氘交换质谱HDX MS氢氘交换质谱HDX MS 蛋白质等电点测定蛋白质等电点测定    了解更多了解更多
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检测平台
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检测分析平台:高分辨率质谱仪、高效液相色谱、气相色谱、NMR;

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蛋白质组分析平台Label-freeiTRAQ/TMTSILACSWATHMRM蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析等;

蛋白质组分析平台蛋白质组分析平台蛋白质组分析平台:Label-freeLabel-free、iTRAQ/TMTiTRAQ/TMT、SILACSILAC、SWATHSWATH、MRMMRM;蛋白质定性定量鉴定蛋白质定性定量鉴定、蛋白质差异分析等;

代谢组分析平台靶向代谢组学非靶向代谢组学脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析代谢靶标鉴定

代谢组分析平台代谢组分析平台代谢组分析平台:靶向代谢组学靶向代谢组学、非靶向代谢组学非靶向代谢组学、脂质组学分析脂质组学分析;通量达1000种代谢分子、代谢通路分析代谢通路分析、代谢靶标鉴定代谢靶标鉴定。

蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、多肽、抗体从头序列分析。

蛋白质从头测序平台蛋白质从头测序平台蛋白质从头测序平台:Obitrap Fusion Lumos质谱仪、PEAKS软件分析;100%序列测定,精准蛋白、多肽、抗体从头序列分析。

生物制药分析平台生物药物鉴定变异性分析纯度分析

生物制药分析平台生物制药分析平台生物制药分析平台:生物药物鉴定生物药物鉴定、变异性分析变异性分析、纯度分析纯度分析。

生物信息学分析蛋白质组学生物信息学分析代谢组学生物信息学分析

生物信息学分析生物信息学分析:蛋白质组学生物信息学分析蛋白质组学生物信息学分析、代谢组学生物信息学分析代谢组学生物信息学分析。

 

 

 

 

 

 

 

 
特色项目
特色项目

 

 

 

 一、蛋白测序一、蛋白测序

蛋白测序服务两种主要分析方法:Edman降解(Harvey和Ferrier,2011; Bauer等,1997)和质谱分析(MS)(Sahukar等,2016)。蛋白质测序和鉴定常用质谱法,Edman降解法是表征蛋白质N端重要的方法之一。

蛋白测序服务蛋白测序服务两种主要分析方法:Edman降解Edman降解(Harvey和Ferrier,2011; Bauer等,1997)和质谱分析(MS)(Sahukar等,2016)。蛋白质测序和鉴定常用质谱法,Edman降解法Edman降解法是表征蛋白质N端重要的方法之一。

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司Edman降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析N端测序C端测序全序列分析,以及基于Edman降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司Edman降解测序Edman降解测序系统对蛋白质序列进行分析,提供基于质谱的蛋白测序分析基于质谱的蛋白测序分析服务,包括对蛋白质的氨基酸组成分析氨基酸组成分析,N端测序N端测序,C端测序C端测序和全序列分析全序列分析,以及基于Edman降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质,提供基于从头测序法的蛋白质从头测序蛋白质从头测序服务,对蛋白序列进行分析。
蛋白测序服务流程
蛋白测序服务流程

 

 

 

 
蛋白测序服务优势
蛋白测序服务优势

 

 

① 采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

① 采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

② 可实现对所测定靶蛋白序列100%的覆盖;

② 可实现对所测定靶蛋白序列100%的覆盖;

③ 可测定蛋白N端多达70个氨基酸序列;

③ 可测定蛋白N端多达70个氨基酸序列;

④ 可测定多种形式的样品:蛋白溶液、PVDF蛋白条带;

④ 可测定多种形式的样品:蛋白溶液、PVDF蛋白条带;

⑤ 样品用量低:蛋白样品仅需5-10ug,即可完成检测;

⑤ 样品用量低:蛋白样品仅需5-10ug,即可完成检测;

⑥ 测序不受N端封闭,PEC和糖基化等N端修饰的影响。

⑥ 测序不受N端封闭,PEC和糖基化等N端修饰的影响。

 

 二、蛋白质组学二、蛋白质组学

 

 

蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”,它们可成为新药物设计的分子靶点,或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实,那些世界范围内销路好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此,蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。

蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”,它们可成为新药物设计的分子靶点,或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实,那些世界范围内销路好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此,蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学靶向蛋白质组学多肽组学翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC,提供定量蛋白质组学定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学靶向蛋白质组学、多肽组学多肽组学、翻译后修饰蛋白组学翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学4D蛋白质组学服务,助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

 

 

 

 
不同技术的比较
不同技术的比较

 

 

 

 
蛋白质组学服务优势
蛋白质组学服务优势

 

 

① 高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

① 高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析,发现新的生物标记物;

② 体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

② 体内体外多种蛋白质标记方法,适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

③ 质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

③ 质谱分析灵敏度高,实验结果重复度高;

④ 可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

④ 可检测较低丰度蛋白,线性范围广;

⑤ 专业生物信息学分析,分析更系统准确。

⑤ 专业生物信息学分析,分析更系统准确。

 

 三、代谢组学三、代谢组学

代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞,生物流体,组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。 这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。

代谢组学代谢组学(英语:metabolomics)是对细胞,生物流体,组织或生物体内的小分子(通常称为代谢物,metabolites)的大规模研究。 这些小分子及其在生物系统中的相互作用统称为代谢组。能够对生物样本中的代谢物进行全面分析的一项新兴技术,被定义为代谢组学技术。
百泰派克生物科技代谢组学分析方案
百泰派克生物科技代谢组学分析方案

 

 

气相色谱-质谱联用 (GC-MS) :常用于水溶性代谢物(需要衍生化)、部分脂类和有机酸的靶向分析。

气相色谱-质谱联用 (GC-MS)气相色谱-质谱联用 (GC-MS) :常用于水溶性代谢物(需要衍生化)、部分脂类和有机酸的靶向分析。

液相色谱-质谱联用 (LC-MS) 非靶向代谢组学靶向代谢组学非靶向脂质组学靶向脂质组学。常用于氨基酸、糖类、醇类、有机酸、胺类、TCA循环中间体等水溶性小分子以及脂质大分子的靶向和非靶向分析。

液相色谱-质谱联用 (LC-MS) 液相色谱-质谱联用 (LC-MS) :非靶向代谢组学非靶向代谢组学,靶向代谢组学靶向代谢组学,非靶向脂质组学非靶向脂质组学,靶向脂质组学靶向脂质组学。常用于氨基酸、糖类、醇类、有机酸、胺类、TCA循环中间体等水溶性小分子以及脂质大分子的靶向和非靶向分析。

核磁共振法 (NMR Spectroscopy) :常用于简单样品或纯化样品的的物质鉴定和分析。

核磁共振法 (NMR Spectroscopy) 核磁共振法 (NMR Spectroscopy) :常用于简单样品或纯化样品的的物质鉴定和分析。

*包括血液、血清、尿液等体液样品,细胞、组织、器官或细菌等样品均可进行代谢组学分析。

*包括血液、血清、尿液等体液样品,细胞、组织、器官或细菌等样品均可进行代谢组学分析。

 

 
非靶向代谢组学研究路线
非靶向代谢组学研究路线

 

 

 

 

 

 

1. 代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物;

1. 代谢谱分析(也称为差异表达分析):在一组实验和对照样品中,寻找丰度改变有统计学意义的感兴趣代谢物;

2. 鉴定:进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构;

2. 鉴定:进行代谢谱分析后,测定这些代谢物的化学结构;

3. 解释:解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。

3. 解释:解释所发现的代谢物与生物过程或生物状态之间的关联。

 

 
靶向代谢组学分析内容
靶向代谢组学分析内容

 

 

 

 四、多组学整合分析四、多组学整合分析

多组学整合分析随着高通量技术的广泛应用而生,研究人员可以从基因组、转录组蛋白质组、交互组、表观基因组、代谢组、脂质体和微生物组等不同分子层面大规模获取组学数据,多组学整合数据分析使得生物学发生了革命性的变化,促进我们对生物过程和分子机制的深刻理解。随着高通量组学方法在生物样品分析中的使用,每天都生成万亿到千兆字节大小的数据文件。从层面上的研究逐步走向完善,从部分到整体也是一种必然的趋势。多组学整合数据分析不仅仅是数据的拼接,更是对生物学解释的深入研究,为基础生物学以及疾病研究提供新思路。

多组学整合分析多组学整合分析随着高通量技术的广泛应用而生,研究人员可以从基因组、转录组转录组、蛋白质组蛋白质组、交互组、表观基因组、代谢组代谢组、脂质体和微生物组等不同分子层面大规模获取组学数据,多组学整合数据分析使得生物学发生了革命性的变化,促进我们对生物过程和分子机制的深刻理解。随着高通量组学方法在生物样品分析中的使用,每天都生成万亿到千兆字节大小的数据文件。从层面上的研究逐步走向完善,从部分到整体也是一种必然的趋势。多组学整合数据分析不仅仅是数据的拼接,更是对生物学解释的深入研究,为基础生物学以及疾病研究提供新思路。

 

 

 

 
多组学整合分析技术优势
多组学整合分析技术优势

单一组学分析方法可以提供不同生命进程或者疾病组与正常组相比差异的生物学过程的信息。但是,这些分析往往有局限性。多组学方法整合几个组学水平的信息,为生物机制提供了更多证据,从深层次挖掘候选关键因子;通过将基因、mRNA、调控因子、蛋白、代谢等不同层面之间信息进行整合,构建基因调控网络,深层次理解各个分子之间的调控及因果关系,从而更深入的认识生物进程和疾病过程中复杂性状的分子机理和遗传基础。

单一组学分析方法可以提供不同生命进程或者疾病组与正常组相比差异的生物学过程的信息。但是,这些分析往往有局限性。多组学方法整合几个组学水平的信息,为生物机制提供了更多证据,从深层次挖掘候选关键因子;通过将基因、mRNA、调控因子、蛋白、代谢等不同层面之间信息进行整合,构建基因调控网络,深层次理解各个分子之间的调控及因果关系,从而更深入的认识生物进程和疾病过程中复杂性状的分子机理和遗传基础。

 

 

 

 
 
值得您信赖的质谱分析专家!
 
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