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大环类和糖苷类 小分子化合物库 | MedChemExpress

2021年10月13日 16:56   学术化工

上海皓元生物医药科技有限公司 发布 访问商铺

关键字:化合物库,小分子
 
大环类(Macrocycles)化合物
大环类(Macrocycles)化合物通常是指结构中含有 12 个或以上原子组成的环状结构的分子。很多时候,大环类分子不太符合“Rule of 5”(Ro5),例如大环类通常具有较大的分子量、更具极性的骨架结构、更多的氢供体受体等。但是,正是由于这些结构特点使得大环类具有传统小分子药物所缺少的优势。

首先,较大的分子量和空间结构使得大环类可以结合蛋白靶点表面较大的“hot spot”;其次,大环类的结构特点使其具有半刚性(semi-rigidity)的分子构象,这保证了必要的灵活性以更好的适应结合位点的空间结构。这些特点对于模拟蛋白蛋白相互作用(PPIs)的结构域至关重要,因此,大环类物质在 PPIs 的药物开发中的应用越来越多。而 PPIs 是公认的难成药的靶点类型之一。此外,大环类物质还具有较高的选择性和代谢稳定性。很多大环类物质被报道表现出与 Ro5 背道而驰的特性,例如环孢霉素 A(Cyclosporin A, CsA)分子量超过 1.2 KDa,口服仍具有生物活性。大环类物质这些“beyond Rule offive, bRo5”的特性使其在难成药靶点的药物研发和新型药物的开发中收到越来越多的青睐。MCE 新上线的大环类化合物库,包含了环肽、冠醚等几百个大环类物质,适合用来筛选靶向难成药靶点(如 PPIs)的化合物。  

图1. 大环类 bRo5 特性

糖苷类(Glycosides)是由糖与非糖物质(配基)组成的化合物。很多植物来源的天然产物是糖苷类物质,如黄酮苷、香豆素、强心苷、皂苷、生物碱等,均具有重要的生物活性。此外,很多抗生素也属于糖苷类物质,例如万古霉素(Vancomycin)、博来霉素(Bleomycin)等。值得一提的是,糖苷类物质不但本身可以用作关键的活性物质,也可以用来改善药物本身的药代动力学参数,在药物开发的过程中扮演重要角色。MCE 新上线的糖苷类化合物库,按照糖苷键的不同类别,包括氧苷、氮苷、硫苷等糖苷类物质,可为您筛选糖苷类药物提供更多便利。
图2. 大环类和糖苷类代表化合物 

此外,MCE 化合物库新增分组,均是根据不同结构进行分类的化合物库,方便您根据不同结构特点进行选择。目前该分组中包括片段库、肽拟似物库、大环类和糖苷类化合物库,后续仍会持续更新,期待您的关注。

参考文献
[1] Curr Opin Chem Biol. 2017Jun;38:45-51. PMID: 28319811.
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