胰蛋白酶法在脱细胞时会脱去细胞外基质的蛋白质吗

可以那么理解。
胰蛋白酶的作用是使细胞间的蛋白质水解从而使细回胞离散。不同的组织答或者细胞对胰酶的作用反应不一样。胰酶分散细胞的活性还与其浓度、温度和作用时间有关，在pH为8.0、温度为37℃时，胰酶溶液的作用能力最强。